文学与传播系团总支：立足系情，形成“用理想信念育明德之人，用文化育中文情怀之人，用专业育博学之人，用文体育强体健心之人，用社会实践育奉献笃行之人”的育人模式。以学生干部系列培训、周四论坛、周日党课学习为基础，深入加强理想信念教育，以学生社团为重要载体，积极开展一系列丰富多彩的学生活动，如国学达人知识竞赛、超级演说家、校园诗词大会等，提升了学生综合素质。该系团总支连续三年获得“五四红旗团总支”荣誉称号。
经济管理系团总支：在校团委和系党总支的领导下，团结带领全系团员青年，加强团组织建设和思想引领。通过组织生活、主题活动、社会实践等多种形式、多种渠道对大学生进行思想教育，让青年大学生树立正确的世界观、人生观、价值观。
连续六年被校团委评为“五四红旗团总支”，系“三下乡”社会实践队连续三年被评为省级优秀服务队。经济管理系团总支将继往开来，全力打造成思想到位，制度全面，组织完善，创新能力强，实践能力高的团总支。
美术系团总支：秉承“厚德明志、博艺创新的系训，坚持“德智体美、以德为先”的育人标准，深入开展团员教育和思想引领，坚持全程育人、全方位育人的原则，深入细致地全面做好团员思想政治教育、心理健康教育、学生安全教育、学风引领教育和创新创业教育，走出了一条别具特色的基层团组织建设之路。连续五年被评为菏泽学院 “五四红旗团总支”，2014年度被评为菏泽市“五四红旗团总支”，所属青年志愿者服务队被评为省级优秀服务队。
计算机与信息工程系团总支：现有共青团员1253人。近年来，计算机与信息工程系团总支多次带领学生参加全国 “甲骨文杯”JAVA程序设计大赛等国家级学科竞赛，近十余年积极参加山东省大中专学生志愿者 “三下乡”社会实践活动，多次获先进团队奖。为增强学生创新创业能力，计算机与信息工程系团总支遴选十余名创业导师、培养数百名学生，并指导学生成立山东博导智能科技有限公司，目前该公司已正式运营。该系团总支多次获得“五四红旗团总支”称号。
化学化工系团总支：以立德树人为工作重心，以对青年学生的思想引领和成长服务为抓手，在思想政治教育、团的自身建设和青年团员综合素质拓展等方面取得了一定成绩。团总支以重大节日、重要节点为契机，广泛开展思想政治教育，充分发挥基层团组织的战斗堡垒作用。积极推进共青团工作网络化，重视微信和微邦平台建设，更便捷地了解青年学生，关心他们成长成才。2016年7月，该系“筑梦乡村行”大学生志愿服务队到菏泽市牡丹区吴店镇开展义务支教、支农、科普宣传等志愿活动，深受当地群众好评。
初等教育系团总支：秉承“引导青年、凝聚青年、培养青年、服务青年”的工作宗旨，采取思想引导与青年实际相结合的方式，以党建带团建；紧抓科技创新，坚持文化育人，竭诚服务青年学生成长成才；拓展育人载体，加强社团文化、志愿服务建设，全面提高青年学生综合素质；夯实工作基础，加强团组织、团干部队伍建设，形成了具有青年工作特色的良好格局。初等教育系“七彩课堂”义务支教服务团荣获山东省“三下乡”社会实践活动优秀服务团队，系团总支连续三年被评为“五四红旗团总支”。
学前教育系团总支：以“抓品牌，树特色，争创一流团总支”为目标，采取“寓教育于社团，寓教育于活动，寓教育于生活，寓教育于实践，寓教育于节日”等形式，深入细致地做好大学生思想政治引领工作。组织开展丰富多彩的社团活动，社团导师制、全覆盖，使该系青年团员思想政治素质整体大幅度提高，感恩社会、回报社会蔚然成风，踊跃参加“西部计划”“三下乡”、“相约雷锋月，共同做义工”等志愿服务活动。精诚团结、锐意进取、开拓创新，该系团学办公室被授予“巾帼文明岗”称号，多次荣获“红旗团总支”、“社团工作先进单位”、“体育道德风尚奖”、大学生辩论赛一等奖、红歌比赛一等奖、舞蹈大赛一等奖等奖项。
蒋震机电工程学院团总支：切实加强基层团组织建设，积极开展双创工作和课外活动，提高团员综合素质，连续多年获得学校“五四红旗团总支”荣誉称号。近三年，团总支两名老师获得“三下乡”优秀指导教师，社团两次获得山东省优秀科技社团，两名社团干部荣获山东省优秀科技社团干部，1个团支部被评为 “全国高校活力团支部”。 2016年在山东省大学生各类科技、学科竞赛中获得一等奖11项、二等奖20项、三等奖9项，获得国家级竞赛一等奖4项、二等奖4项。开展创业论坛，建立创业友谊联盟，承办菏泽学院首届创新创业示范班、SYB创业培训、创新创意思维征集大赛等。
陈 娟 尹洪军 董升太 尹 鹏 刘 静 吕高原岳 雷 渠东玲 李诚举 胡爱林 吴瑞凡 张华光王慧丽 张丽华 朱德生 李战国 许 腾 姜保周田 丰 李 赛 杨 杰 宋 艳 薛晓鹤 陆纯子赫明存 刘 水 吴培启 刘艳丽 李 静 贾建运赵 杰 陈凌云 孙合军 李 伟 黄燕丽 李亚峰杨 冬 李 靖 刘慧娟 王盛楠 张青松 孟海岭
社会科学系 文学与传播系教育科学系 物理与电子工程系体育系 资源与环境系园林工程系 药物科学与技术系蒋震机电工程学院 学前教育系
李瑾辰 张海同 宋 艳 张丽竞 杨 冬 周景雷李 静 吴培启 孙合军 孙亚梅 王 萌 宋 宁杨 杰 周长路 刘 水 潘守皎 王秀丽 王瑞斌陈凌云 韩艳君
法律系 经济管理系外国语系 美术系音乐系 数学系计算机与信息工程系 化学化工系生命科学系 初等教育系单县分校区 郓城分校区
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